非人靈長類動物完整染色體序列首次發(fā)布
張佳欣
由美國賓夕法尼亞州立大學(xué)和美國國家人類基因組研究所領(lǐng)導(dǎo)的國際合作小組首次生成了非人靈長類動物的完整染色體序列,相關(guān)論文發(fā)表在29日的《自然》雜志上。這些序列揭示了不同物種Y染色體之間的顯著差異,顯示出它們快速進(jìn)化的歷史,還揭示了以前未被研究過的類人猿基因組區(qū)域,為物種多樣性和進(jìn)化提供了重要見解。
靈長類物種是現(xiàn)存與人類最接近的“親戚”。此次,研究人員對黑猩猩、倭黑猩猩、大猩猩、婆羅洲猩猩、蘇門答臘猩猩,以及另一種與人類關(guān)系較遠(yuǎn)的靈長類物種——合趾猿的染色體進(jìn)行了測序,重點研究了它們的X和Y染色體。
結(jié)果發(fā)現(xiàn),在6種猿類中,Y染色體在各種特征(包括大。┥系淖儺愋远急萖染色體大得多。X染色體所含核苷酸字母的數(shù)量從黑猩猩的1.54億個到大猩猩的1.78億個不等,相差約2400萬;相比之下,Y染色體所含核苷酸字母數(shù)量從合趾猿的3000萬個到蘇門答臘猩猩的6800萬個不等,相差約3800萬。
物種間共享的DNA序列數(shù)量在Y染色體上也更具可變性。為了將猿類染色體序列與人類X和Y染色體進(jìn)行比較,研究人員使用了一種名為“比對”的計算方法。
深圳華大生命科學(xué)研究院副院長金鑫在接受科技日報記者采訪時說:“比對指的是一段序列與另一段序列的比較。如果相似度比較高,我們就說‘比對成功’,或‘比對上了’。”
研究發(fā)現(xiàn),超過90%的猿類X染色體序列與人類X染色體比對成功,表明X染色體在數(shù)百萬年的發(fā)展過程中進(jìn)化速度較慢。相比之下,只有14%—27%的猿類Y染色體序列與人類Y染色體比對成功。
此外,在Y染色體上,重復(fù)序列所占染色體的百分比變化也很大。根據(jù)物種的不同,重復(fù)序列占X染色體的62%—66%,而占Y染色體的71%—85%。
該研究帶頭人、賓夕法尼亞州立大學(xué)教授卡捷琳娜·馬科娃表示,這些物種的Y染色體差異之大令人非常驚訝。其中一些物種僅在700萬年前才從人類譜系中分化出來,從進(jìn)化角度來看,這一時間并不長,這表明Y染色體進(jìn)化得非?臁